2月初 东北抗日联军第5军成立 : 2月初,东北反日联合军第5军在镜泊湖南湖头开会,听取了魏拯民传达组编东北抗联决定的精神,遂将东北反日联合军改编为东北抗日联军第5军。周保中任军长,柴世荣任付军长,张建东任参谋长,胡仁任政治部主任,下辖两个师。抗日联军第5军成立后,军主力部队向中东路道北转移,以军部率第3、6、7团在宁安地区坚持斗争。1937年1月28日,抗联第5军在大盘道全歼日军官兵300余人,并缴获全部辎重物资。3月19日,第5军和第3、4、8、9军各一部,在周保中指挥下,进攻依兰县城,共歼日军约300余人,缴获步枪320余支,轻机枪10挺,弹药和其他军需物资。8月,敌伪第29团600余人,在勃利暴动,参加了抗日联军。由李文彬率领三道河子森警大队150余人起义,参加了第5军,被编为警卫旅,不久,扩编为第3师。7月29日,第5军和第4、7、8、10军合编成东北抗日联军第2路军。总指挥兼政委周保中。由柴世荣任第5军军长。
1938年开始, 日军向三江地区抗日联军发动火“讨伐”。5月,以第5军1师为主组成西路部队。7月,越过老爷岭。穿过中长路,在五常地区同10军会合。8月以后,西征的第1师部队返回牡丹江下游刁翎地区。是年冬, 日军对刁翎发动大“讨伐”。周保中率8、9军去方正县活动,第5军仍在牡丹地区坚持斗争。1939年3月,王克仁代理第5军政治部主任。第5军转向穆棱,于泉眼河歼追敌140余人。5军亦受到很大损失,王克仁牺牲。年底,季青被任命为政治委员。不久,第5军余部缩编为第2路军第5支队。1940年,第5支队在东宁县片底子进行隐蔽游击活动。1941年初,奉命退至苏联境内北野营。