平定广东商团叛乱是孙中山维护广东革命根据地的第一次重大军事行动。广东商团原来是辛亥革命后成立的商人自卫组织,后来被港英当局和买办地主阶级所操纵。随着中国革命的深入发展,帝国主义加紧了对广东革命的干涉和破坏。英帝国主义用大量金钱、军火,支持英国汇丰银行大买办陈廉伯控制反革命武装组织商团,企图颠覆尚处在摇篮中的广东革命政府。国民党右派分子陈恭受为首领,发展成一支拥有数千人的反动武装。1924年5月,广东商团公开与广东革命政府对抗。10月10日,广州各界为庆祝辛亥革命胜利13周年举行的游行集会时,商团竟然向游行群众开枪射击,当场死伤数十人,并张贴“驱逐孙文”“打倒孙政府”等反动标语,妄图夺取广东革命政权。革命政府处于危机之中。1924年10月15日,孙中山调黄埔学生军联合滇、桂、湘、粤各军,分五路向商团军发起总攻,在工农武装支持下,歼灭了商团军,拔掉了广东革命政府的心腹之患,广东革命政府得以初步稳定。