张格尔叛乱是19世纪20年代维吾尔贵族张格尔在南疆发动的叛乱。张格尔是已故回部大和卓布拉尼敦之孙,从小在浩罕国(今阿富汗)长大。1759年,清朝平定回部大小和卓叛乱,布拉尼敦被杀,其子萨木萨克逃往浩罕国,张格尔是萨木萨克次子。18世纪末,浩罕国已成为英国的殖民地,因此张格尔自幼受到英国殖民者的训练。英国多次要求在新疆通商,均被清政府拒绝,于是便教唆张格尔反清,想乘机进据南疆。浩罕国也想东进,得到南疆一些地方。张格尔在英国和浩罕国的怂恿下,想重新获得和卓家族在南疆的支配地位。1825年10月,张格尔借浩罕国兵万余,在南疆聚众反叛。叛军攻陷喀什噶尔,英吉沙尔、页尔羌、和阗也相继落入叛军之手。张格尔占领这些地方后,纵容其部下肆意烧杀抢劫,并强征15岁以上男丁入伍,由于张格尔以维族统治者的姿态残暴奴役维族人,很快失去维族人民的支持。1826年秋,清政府调集了陕西、吉林、黑龙江、甘肃、四川等省兵36000余名会集阿克苏,在浑巴什河大败叛军,奠定了收复南疆的基础。次年,清军相继收复喀什噶尔、英吉沙尔、页尔羌、和阗。1828年初,张格尔再次侵入阿图什,由于维吾尔族人民的奋力抵抗和清军的追击,张格尔叛军和浩罕国军队被打败。张格尔走投无路,逃往喀尔铁盖山,军民将山团团围住,杀声震天,张格尔自杀未遂,被清军活捉。同年5月,清军将张格尔解到北京处死。平定张格尔叛乱是嘉道时期唯一的一次闪光。这次含有外来入侵性质的叛乱被平定,既打击了英国等国向新疆侵略扩张的野心,也证明了清王朝还有相当大的力量来保卫领土的完整。