《大洞真经》全称《上清大洞真经》、《上清大洞真经三十九章》、《中央黄老元素君大洞真经三十九章》,又称《三十九章经》、《九天太真道经》等。是道教上清派的早期经典。撰人不详。北宋陈景元《上清大洞真经玉诀音义》引南朝梁陶弘景《登真隐诀》佚文中有“《大洞真经》本,……又闻有得杨许《三十九章》者”等句,杨羲、许谧、许翙皆两晋间人。陶弘景《真诰·叙录》亦载东晋时人孔默自许氏处得道经,后其子于中见有《大洞真经》云云。则此经东晋时已出。敦煌P2337《三洞奉道诫仪范》卷5《上清大洞真经目》著录此经一卷。此经历代有多种传本。《正统道藏》收有三种文本:一为南宋末茅山38代宗师蒋宗瑛校勘本,前有北宋茅山23代宗师朱自英序,又有咸淳壬申年(1272)嗣法程公端、明初嗣汉43代天师张宇初2人后序,此为道教中通行本;二为《太上无极总真文昌大洞仙经》,称蜀本;三为《大洞玉经》。今按,蒋宗瑛之《上清大洞真经》乃唐传之合校本,特未全尔。敦煌经CH75、IV2残存《高上虚皇君道经第一》,经文则为“《大洞玉经》曰”云云,其文与朱校本之卷2中经文略同,但无朱校本中存思太微小童等神之法和咒语,敦煌写本“泯”作“”避唐太宗名讳,可知为唐写本;《云笈七签》卷42《存大洞真经三十九真法》称出《三十九章经》,录存思太微小童等神之法,与朱校本文句略同,而无朱校本之《大洞玉经》文。朱校本则合有2本而详略互异。又,敦煌写本和朱校本有《高上虚皇君道经》等39章经目(敦煌本残1章),但无经文,经文见录于《云笈七签》卷8《释三十九章经》。《云笈七签》所录道经,例皆唐本。盖唐本有3,朱氏得其2而校勘之。
        朱校本分此经为6卷。卷1为《诵经玉诀》,内有诵本经之诀法、咒文、仪规,并有《诵经入室存思之图》10幅,附《大洞灭魔神慧玉清隐书》等文6则。主要讲存思存神、闭炁咽炁诸术,咒文中则有“九炁还肝”、“三气归心”、“七炁守肺”、“五气卫肾”、“一气侍脾”等内修语。其余5卷为此经正文,共39章。据道教说法,有高上虚皇道君等39神入人身39户,每神著经1章,每章存思一神。各章体例依次为:所存思之神的名字及在人身部位和“化生血液”等功能、《大洞玉经》本文、咒语、符书。每章配存思图1幅、符书一通。经末有《徊风混合帝一秘诀》,为诵咏39章经后存思养气之法。此经以存思为主旨,串通上清派叩齿、咽液、吐纳等养生方术,历来受道教重视,为洞真上清之首经。