在南京应天府(河南商丘),故名。原为宋初名儒戚同文旧居和讲学之所。宋真宗大中祥符二年(1009年),应天府民曹诚于其址造学舍一百五十间,聚书一千五百卷,广招生徒,讲学甚盛,并以所造之学舍捐给政府,诏赐额为应天府书院,令戚同文之嫡孙舜宾为主教,曹诚为助教。为宋初四大书院之一。宋天圣四年(1026年)晏殊知应天府,聘范仲淹掌教,多有改革。宋仁宗景祐二年(1035年)改为府学。后明嘉靖、清乾隆年间曾两次修葺。因院址所在地又称睢阳,故又称睢阳书院。