浙江吴兴人。一字爱存。早年留学日本,1908年(光绪三十四年)入东京帝国大学理学院,专攻地质。回国后,任南京临时政府实业部矿政司地质科科长。1913年创办我国第一所培养地质专门人才的高等学校地质研究所,任所长,为我国地质事业的创始人。1916年创办地质调查所。又任北京大学和北京高等师范学校教授。1928年至1945年先后被聘为故宫博物院专门审查委员、中央研究院地质调查所特约研究员。1945年后任编译馆编纂。曾参与发起中国地质学会,并任首届会长。建国后,任中国地质工作者指导委员会顾问。1951年9月6日病逝。一生著述甚丰,其中《石雅》是中国第一部地质、岩石、矿物等方面总结性的著作。