印度尼西亚是世界上穆斯林人数最多的国家。除巴厘岛以印度教为主、安汶岛以基督教为主以外,其它大小岛屿的居民主要信奉伊斯兰教。一般认为,伊斯兰教于公元13世纪末传入印尼。此前,印尼居民主要信奉印度教和佛教,宗教史学家称之为印度化时期。大约16世纪印尼完成伊斯兰教化。目前全国共有清真寺和小礼拜堂369760座,位于雅加达市中心的伊斯蒂拉尔清真寺是东南亚最大、最华丽的清真寺,可容纳10万余人。近年来政府对伊斯兰信徒的宗教生活十分重视,每逢伊斯兰教的重大节日,都举行盛大的庆祝活动,有政府高级官员亲自参加并发表讲话。伊斯兰教政党主要是建设团结党,成立于1973年1月5日,由伊斯兰教师联合党(现改名伊斯兰教师联合会)、印尼穆斯林党(已不存在)、印尼伊斯兰联盟党(现改名印尼伊斯兰联盟)和白尔蒂党(现改名为伊斯兰真谛协会)合并而成。印尼虽然穆斯林人口众多,但伊斯兰教不是国教。宪法中规定了政教分离的原则和信仰宗教的自由。为了保持政权的稳定,政府一方面对印度教、佛教、基督教和天主教等采取宽容态度,另一方面也采取措施限制伊斯兰教极端势力的发展。