菲律宾南部的巴交人遵守伊斯兰教习俗,如进行祈祷、不吃猪肉、举行伊斯兰教式婚礼和割礼等等。此外还有一套自己的宗教信仰,他们认为人死后有灵魂存在,成为精灵。祖先的灵魂多为邪恶精灵。疾病、灾祸和恶运是由三种主要恶灵作祟引起的。这三种恶灵是乌马格、棚瓜和赛坦。他们认为乌马格是人的灵魂,人死后离开躯体,在墓地、红树林沼泽区和其他地方徘徊。当人受到惊吓,或胸部和腹部受到重击时,也会导致灵魂出窍。有时死者后代会为死者寻找失落的灵魂,但死者的灵魂往往不予合作,甚至给人带来恶运。如果一个人生前作恶,或者埋葬时未能洗净,死后的灵魂就称作棚瓜。它出没于陆地,晚上出来吓人,所以巴交人总是害怕在晚上上岸。赛坦则常常导致人们死亡或患精神病。为了对付这些恶灵,便出现一些半职业性的巫师,负责主持各种仪式。这些巫师或宗教师分两种:一种称为伊玛目,是男性宗教师,负责守灵、丧葬、婚礼和祭祀祖灵等仪式。另一种称为“津”,性别不拘,专门对付使人生病的恶灵。巴交人生活在海上,但死后实行土葬,埋在专作墓地的小岛。虽然这种墓岛并非神圣禁地,但因巴交人害怕祖灵,总是避免接近它。巴交人对祖先的灵魂充满恐惧,而不是崇拜。