中世纪大学的产生,犹如茫茫暗夜的一线曙光,预示着人类文化黎明的到来。
        但是,当时的教育受控制于教会。中世纪大学从产生时起,就成为宗教与世俗势力互相争斗、宗教内各个派别之间争斗的阵地。
        巴黎大学是一所在巴黎圣母院的附属神学院的基础上建立起的中世纪大学。
        巴黎大学刚一成立,就成为教会注目的重点。当时每一位在巴黎大学任职的教师,不仅要得到教师会的承认,而且还要得到巴黎教会发给的任职证书,巴黎教会利用这一职权压制、打击大学的教师。他们可以任意逮捕、拘禁师生。因此,巴黎大学与教会展开了长期的斗争,到了十三世纪,巴黎大学师生才逐步取得一些胜利。但是,仍然没有改变教会控制大学的局面。教会对巴黎大学的控制,还表现在派遣多名忠于教会的某些教团的托钵僧打入大学,控制学生的思想言行。当巴黎大学与国王发生冲突时,遭到军队的镇压,大学向教会申诉,教皇乘机宣布,巴黎大学受教皇保护,接着派忠于教会的修道士进入巴黎大学主持神学院,大学拒绝,从此,该大学连续五年处于骚动与械斗之中,教学与学术的发展受到严重破坏。
        教会控制巴黎大学关键在于限制其教学内容。在亚里斯多德著作的问题上,大学师生与教会展开了激烈的斗争。迫于形势,教会不得不改变策略,利用亚里斯多德哲学中的唯心主义部分,改造为符合教义的理论。托马斯·阿奎那是一个典型人物。他31岁时,教会提升他为巴黎大学的神学教授。他利用亚里斯多德哲学中的所有概念,建立起一套庞大的基督教神学体系。到了1254年,经过师生们的斗争,教会允许巴黎大学将亚里斯多德的《物理学》、《形而上学》作为正式课程。
        唯实论与唯名论的斗争在巴黎大学中也进行得极为激烈,但是,随着经院哲学的衰落,其斗争也失去了存在条件。
        总之,巴黎大学自产生之日起,就处于世俗势力与宗教势力、宗教势力各派之间的斗争之中。