1944年,国民党势力进入新疆,取代盛世才的统治,开始对新疆实行直接统治,新疆社会政治经济状况的恶化日甚一日,各族人民的生活濒临绝境,原本已很尖锐的民族矛盾、阶级矛盾更为激化,终于在1944年9月导致了三区(伊犁、塔城、阿山)革命的爆发。
        1944年9月,地处伊犁、塔城地区巩哈县(即今尼勒克县)的哈萨克族、维吾尔族群众,为反对国民党新疆省政府强迫牧民“献马”而发动了武装起义。起义牧民袭击了当地国民党驻军和警察,攻克了尼勒克县城,夺取武器,建立了第一支暴动武装。随之起义迅速波及伊犁各地。11月,伊宁人民为支持尼勒克人民的斗争,发动了武装起义。起义军攻克了国民党的专员公署和警察局,控制整个市区,并成立了伊宁临时革命政府。尔后又相继攻占了绥宁、宁西、博乐、惠远、霍城、温泉等城镇。1945年1月,在艾林巴克一战取得胜利。至此,义军完全控制了整个伊犁地区。到1945年春,各地武装已达万余人。由于暴动武装多为群众自发,缺乏军事人才和必要的军事训练,又互不统属,具有很大的分散性和游击性,加之起事仓促,因而限制了其战斗力的提高。
        随着三区革命形势的发展,为了进一步扩大革命影响,将伊犁、塔城、阿尔泰三区连成一片,战胜国民党军队的反扑,需要把武装斗争的水平提高一步。1945年4月8日,伊犁临时革命政府颁布命令组建民族军,将分散各地的游击队一万余人统一整编。民族军的建立,标志着三区革命武装新的发展和革命斗争进入了一个新阶段。5月间,民族军根据临时革命政府的命令,分兵三路向国民党发动了大规模进攻,至9月先后攻占托里、额敏、裕民、塔城、和丰、乌苏、精河、沙湾等县,使伊、塔、阿三区连成一片。民族军挺进到了距迪化(今乌鲁木齐市)二百公里的玛纳斯河西岸,与国民党军形成对峙局面。迪化已陷于被民族军半包围的状态中。
        9月,随着国际反法西斯战争和中国抗日战争的胜利,国内外的和平呼声日益高涨,要求和平民主的运动正澎湃于全国,国民政府为挽救它在新疆即将崩溃的统治,不得不改变策略,主张和平谈判解决新疆问题。蒋介石发表广播演说,建议“和平解决”新疆问题。新疆三区革命运动的领导者,为响应中国共产党和平民主的政治主张,同意通过和平谈判解决新疆问题。
        10月17日,在苏联驻华大使彼得洛夫和驻迪化、伊犁领事的从中联系下,新疆三区革命运动的领导者组成以阿哈买提江为首的三人代表团和国民政府代表张治中将军在迪化举行和平谈判。双方在先“自由、民主”还是先“和平、统一”,而后“自由、民主”的问题上展开争论。国民政府意在解除三区革命政府的武装,三区革命政府则针锋相对展开揭露和斗争。经双方谈判互作让步,终于达成协议。1946年1月2日,双方代表签订了《中央政府代表与新疆暴动区域人民代表之间,以和平方式,解决武装冲突之条款》。又称“新疆和平条款”,共十一条,主要内容是:
        (一) 三个月内,各县选出县参议会,并由此选举县长;县参议会选出省参议会,监督并协助政府,同时并扩大省政府委员,容纳各民族及各方面人士。
        (二)准予组织民族军队,其数额为骑兵三个团、步兵三个团,总数1.2万人,分别驻扎在三区各地;国民党军队不和民族军队同住一处,以避免发生误会。
        (三)人民有宗教信仰、出版、集会、言论的自由;各级学校得使用本民族文字施教;行政机关和司法机关的文书,汉文和回文并用;确保民族文化和艺术的自由发展。
        (四)税率的规定及其他负担,以不妨碍人民生活和经济发展为标准;商人可遵照商约,自由从事内外贸易。①
        从上述和平条款可以看出:在政治上新疆省政府将实行改组,当地维、哈等民族有了参加政府的权利;在军事上国民党当局被迫承认了民族军的合法地位。双方又于6月6日签署了关于民族军改编的附件。该附件规定:民族军各级指挥官由三区政府保荐。这样,三区革命力量就保住了对军队的领导权,从而也就保住了对伊犁、塔城、阿山三区的控制权。和平条款及其附件实施后,虽然民族军名义上叫“国军”、“保安部队”,但革命军队的性质没变;在经济上,多少减轻了一些人民的负担。“和平条款”的签订,标志着新疆各族人民经过斗争,取得了一定的民族自治的权利,促成了新疆和平局面的实现,是新疆各族人民革命运动的初步胜利。
        根据“和平条款”的规定,1946年6月,新疆省政府实行改组,准备成立新疆省联合政府。7月1日,新疆联合政府正式成立,并颁布了新的施政纲领。国民政府指派张治中担任联合政府主席、三区革命政府指派阿哈买提江等担任副主席及其他领导职务。张治中希望“中央给予新疆人力、财力及其他一切的帮助与精神上之鼓励。”②
        新疆联合政府的政纲规定:各族人民有参政权;各族人民一律平等;扶助自耕农,防止土地集中,促进劳资协调,严禁重利盘剥;增垦农田,开发水利,建立基本工业;统一币制,保证自由贸易等等。但是,国民党集团根本就无意实施这些政纲,而且还有计划地破坏和平条款的实施。在地方政权机关的选举中,国民党军警人员,以极端的恐怖手段,来破坏人民参加政权的活动。例如,阿克苏有一农民就因控告乡长滥用职权而被打得半死;一位青年在群众大会上因要求履行和平条款也遭到殴打;在叶尔羌,39个县参议员中有31人因害怕迫害而逃亡,有两个居民因强调根据和平条款选出的候选人才是公正的,而被打断了四肢。类似事件在各地经常发生。
        国民党新疆当局敢于撕毁和平协定,是和全国形势的恶化相关联的。当时,蒋介石集团在美国的支持下,不顾全国人民的反对,背信弃义地撕毁了《双十协定》,准备向解放区展开全面军事进攻。在这种形势的影响下,国民党新疆当局,在蒋介石集团的支使下,利用“和平谈判”休战的时机,将大批军队开进新疆,从1946年到1947年,国民党军队由四万人增加到十万人;同时还加强了秘密警察的活动,大批逮捕当地民族进步人士和爱国青年知识分子。还在当地民族内部物色代理人,分裂民族团结,以达到瓦解三区革命运动的目的。国民党当局护送新疆各族人民的公敌——大土耳其主义者麦斯武德、艾沙、伊敏等重返新疆,进行反革命活动。
        1947年,随着内战的加剧,新疆的局势也日趋紧张,国民党当局不断制造破坏和平条款的事件。2月,新疆警备司令与麦斯武德,在迪化(乌鲁木齐)等地组织反对“和平条款”的反动游行,并图谋杀害三区革命的领导人。此是撕毁“和平条款”的一个严重步骤,为揭穿这一阴谋并予以反击,三区革命代表向国民党当局提出了严重抗议,乌鲁木齐等地各族劳动人民也举行了示威游行。
        5月,国民政府任命麦斯武德为新疆省政府主席,艾沙为秘书长,并大肆吹嘘说这是所谓“民族政府”,是让新疆人自己治理新疆,实际上这是历代统治者惯用的“以夷制夷”的伎俩而已,是从内部向新疆各族人民展开新的进攻。麦斯武德上台伊始,就忠实执行蒋介石集团的命令,利用其手中的权力,从政治、军事上向三区民族革命力量进攻。他们控制了所有的重要报刊,并创办了《自由报》、《火焰报》、《故乡报》和《阿尔泰月刊》等报刊,大肆宣传大土耳其主义和大伊斯兰主义思想,鼓吹要在新疆建立一个“大土耳其国家”,企图从政治上瓦解新疆民族解放运动。麦斯武德还在国民党集团的支持和授意下,勾结阿山民族叛徒乌斯满、贾尼木汉等,在富蕴、福海、青河等地,举行武装叛乱。
        此外,美国和蒋介石集团为牢固控制既有丰富矿藏和物资资源,又具有极其重要战略地位的新疆,并将其变作为攻苏联和蒙古人民共和国的军事跳板,利用和操纵麦斯武德等民族败类,直接插手策划制造了“北塔山事件”。
        北塔山位于乌鲁木齐、阿山和哈密之间,是一个军事要隘。1947年2月,乌斯满在美国驻乌鲁木齐副领事马克南和国民党新疆省警备司令宋希濂的唆使下,武装进攻伊犁、塔城、阿山三区革命根据地。被击败后,窜至北塔山地区,伺机再动。此后,美国协同国民政府将大批武器、粮、款及地图、地形照片等军事资料供给乌斯满,指使他们,一方面继续以武力对抗三区革命运动,另一方面,寻机向苏、蒙边境进行武装挑衅,制造反苏反共借口,转移人民视线,以冲淡当时全国人民反内战、反饥饿、反对美帝国主义侵略的政治空气。同年4月,乌斯满军侵入蒙古人民共和国领土小松树沟。蒙方几次令其退出,乌部不但不走,反而枪杀了蒙方通讯员2人。6月5日,蒙军予以还击。马克南赶到北塔山亲自指挥乌部作战。
        北塔山事件发生后,美蒋集团制造所谓“苏蒙侵略中国疆土”等谣言,以混淆视听,进行反苏反共宣传。在铁的事实和苏、蒙政府的反击下,上述谣言和乌斯满的进攻,很快被揭穿和粉碎。
        由于国民党当局不断制造破坏和平条款的事件,最后终于导致新疆和平局面的破裂和联合政府的解体。1947年7、8月间,以阿哈买提江为首的三区革命的代表及其同情者,先后退出了“联合政府”,飞返伊宁。成立不到一年的新疆联合政府终于结束了。